Фамилия Апкадиров образована от имени Апкадир, которое в свою очередь восходит к арабскому имени Абдулкадир (Абд аль-Кадир) — «раб Всемогущего» (одно из имён Аллаха — аль-Кадир). В тюркской языковой среде, особенно у башкир и татар, начальное «абд» часто редуцировалось до «ап», а «уль» терялось. Так сложное арабское имя превратилось в более краткое Апкадир, а фамилия по отчеству — в Апкадиров.

Модель образования типична для русских фамилий тюркского происхождения: суффикс -ов/-ев присоединялся к основе, указывая на принадлежность роду. Буквально Апкадиров — «сын Апкадира» или «из рода Апкадира». Такая адаптация мусульманских имён под русскую патронимическую систему активно шла в XIX — начале XX века, когда татары и башкиры получали официальные фамилии.

Версия, что основа напрямую связана с арабским «кадир» (могущественный), без промежуточного имени, маловероятна: суффикс -ов ясно указывает на имя отца, а не на качество. Географически фамилия встречается преимущественно в Башкортостане, Татарстане и Оренбургской области — регионах, где исторически жили башкиры и татары, принимавшие православие или сохранявшие ислам, но получавшие фамилии на русский лад.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Апкадир могло закрепиться как прозвище для человека, чей отец носил полное имя Абдулкадир, но в быту использовал сокращённую форму. Сама фамилия — один из множества примеров того, как длинные арабские теофорные имена через тюркское посредничество ужимались и русифицировались, теряя религиозную окраску, но сохраняя связь с именем предка.