Фамилия Аплякаев — редкий пример, где основа, скорее всего, восходит не к имени или профессии, а к прозвищу, связанному с речью. В её основе лежит диалектный глагол «аплякать» или «аплякаться». В южнорусских и украинских говорах это слово означало «громко плакать», «всхлипывать», «причитать». Соответственно, Аплякаем могли прозвать человека плаксивого, обидчивого или, наоборот, того, кто любил громко и жалобно причитать на похоронах или свадьбах — такой «плакальщик» был востребован в народных обрядах.

Фамилия образована по стандартной русской модели: к основе Аплякай добавили патронимический суффикс -ев (вариант -ов после мягкого согласного). Буквальное значение: «сын Аплякая». Встречается фамилия в Поволжье, особенно в Ульяновской и Самарской областях, а также в Татарстане. Это не случайно: тюркское влияние на местные говоры могло закрепить необычную огласовку — приставка «ап-» вместо привычного «вс-» или «о-» (сравните: «аплякать» и «всплакать»).

Словообразовательный нюанс: суффикс -ай в прозвище (Аплякай) типичен для русских неканонических имён и прозвищ, образованных от глаголов. Такие формы часто давали по характерному действию: Молчай, Гуляй, Дерзай. Аплякай попадает в тот же ряд — имя-характеристика по манере поведения. Других версий происхождения, заслуживающих внимания, нет: связь с тюркским «апляк» (пятно) или с географическим названием маловероятна из-за отсутствия подтверждений в исторических источниках.

Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская по происхождению. В дореволюционных переписях Аплякаевы фиксировались как государственные крестьяне и однодворцы южных губерний. В современной России фамилия остаётся малочисленной — её носителей не более нескольких сотен, что делает её ценной для генеалогического поиска: найти однофамильцев в архивах относительно легко, так как круг семей узок.