Фамилия Апряткина — женская форма фамилии Апряткин. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я, и указывают на принадлежность: «чей?» — сын Апрятки. Поэтому ключ к происхождению — мужское прозвище или нецерковное имя Апрятка.

Самая вероятная версия связывает Апрятку с диалектным глаголом «апрятать» — в некоторых говорах (особенно южнорусских и рязанских) это означало «запрягать», «впрягать лошадь». В таком случае Апряткой могли прозвать работящего крестьянина, конюха или возчика — человека, который постоянно запрягал лошадей. Суффикс -к- в прозвище типичен для обиходной, уменьшительной формы: так же, как из «Запряга» возникло бы «Запряжка», из «Апрята» — «Апрятка».

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование, — искажение имени Епифан или Евпатий через народную переделку. В устной речи «Епифан» мог превратиться в «Апифан», а затем в «Апрят» (через промежуточное «Апрян»). Однако против этого говорит то, что фамилия Апряткин встречается почти исключительно в тех регионах, где слово «апрятать» в значении «запрягать» фиксируется диалектологами, — например, в Тамбовской и Воронежской областях. Это делает «лошадиную» версию более убедительной.

Фамилия не относится к числу дворянских или старых княжеских — её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, а также однодворцами. Сословной привилегированности в ней нет, зато есть чёткая бытовая картинка: предок Апряткиных мог быть тем самым человеком, без которого не выехать в поле.

В написании фамилия устойчива: вариант «Апряткин» фиксируется в метрических книгах XIX века, а двойное «т» объясняется тем, что основа «Апрят-» получила суффикс -к-, и стечение согласных не упрощалось. Встречается также редкое написание «Опряткин» — с акающим произношением, которое отразилось на письме.