Фамилия Аптасов ставит исследователя перед выбором между двумя основными версиями, и у каждой есть свои сильные и слабые стороны. Самая прозрачная и, скорее всего, верная, связывает её с тюркским словом «апта» (или «апт»), которое в разных диалектах означает «месяц», «луна». В таком случае Аптасов — изначально «сын человека по прозвищу Аптас», то есть «Лунный», «Рождённый в новолуние» или «Светлый, как месяц». Такие прозвища давали в тюркоязычной среде, и фамилия могла возникнуть у татар, башкир или других народов Поволжья, а затем, при крещении, перейти в русскую форму с типичным суффиксом -ов.

География бытования фамилии поддерживает эту версию. Основной массив носителей сосредоточен на юге России: Астраханская область, Калмыкия, отчасти Башкортостан. Это регионы, где веками жили тюркские народы, а потомки принимали православие и русифицировали фамилии. В дореволюционных документах встречается вариант «Аптазов» — с заменой «с» на «з» под влиянием казахского или ногайского произношения. Оба варианта, по сути, однокоренные.

Есть и вторая, менее очевидная гипотеза, которую можно назвать скорее курьёзом. В некоторых говорах русского севера слово «аптас» или «оптас» могло означать «обманщик», «плут» (от «оптать» — обмануть). Здесь фамилия превращается в «прозвищную»: Аптас — хитрый человек, его потомки — Аптасовы. Однако эта версия слабее: диалект крайне узкий, и фамилия с таким корнем почти не встречается в северных переписях, зато в татарских родословных аналоги прослеживаются. Социальный контекст тоже говорит в пользу тюркской основы: фамилия не дворянская, не купеческая — судя по всему, крестьянская или мещанская. Её носители, вероятно, были людьми незнатными, но с ярким прозвищем, которое запомнилось окрестным жителям.

Словообразовательная модель проста: основа Аптас + патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»). Ударение, скорее всего, на второй слог — Апта́сов, хотя в некоторых семьях могли закрепить на первый. Фамилия редкая, и её носители, в отличие от массовых Ивановых или Кузнецовых, почти наверняка могут проследить свои корни до конкретного предка с запоминающимся прозвищем.