Фамилия Аптулин — редкий случай, когда прозрачная на первый взгляд основа оказывается не такой однозначной. На слух она кажется типичной для Поволжья: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?»), а корень Аптул- явно отсылает к тюркскому или арабскому имени. Скорее всего, в основе лежит имя Аптулла — один из диалектных или сокращённых вариантов имени Абдулла (араб. «раб Аллаха»). В татарской и башкирской среде имя Абдулла часто звучало как Аптулла, Аптул или Аптулай, а фамилии на -ин от него — обычное дело: Аптуллин, Аптулов, Аптулин.

Однако есть и вторая версия, менее очевидная, но тоже возможная. В русских говорах, особенно на Урале и в Сибири, существовало слово «аптула» — так называли неуклюжего, неповоротливого человека. Если фамилия возникла в среде русских крестьян, её могли дать по прозвищу: Аптула → Аптулин. Правда, эта гипотеза слабее: слово это редкое, локальное, а имя Аптулла встречается в метрических книгах гораздо чаще.

География фамилии подтверждает первую версию. Аптулины — не случайные носители: фамилия устойчиво встречается в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской и Челябинской областях, то есть в зоне давнего контакта тюркских и славянских культур. В дореволюционных ревизских сказках Аптулины записаны как тептяри или государственные крестьяне, что типично для татарских и башкирских родов, перешедших к оседлому земледелию.

Суффикс -ин в данном случае не указывает на русское происхождение: в Поволжье он прирастал к любым именам и прозвищам по модели «чей сын». Так что предок носителя фамилии — скорее всего, человек по имени Аптулла, живший в татарской или башкирской деревне.