Фамилия Апуник — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Она не укладывается в привычные модели русских фамилий на -ов, -ин или -ский, а её суффикс -ик сразу выдаёт возможное западное или южнославянское влияние. Скорее всего, перед нами фамилия украинского, белорусского или польского происхождения: суффикс -ик (как в фамилиях Ковалик, Гончарик) в этих языках обозначал «сын» или «ученик» мастера, либо служил уменьшительным.

Основа «Апун-» — самая загадочная часть фамилии. Самый прямой вариант: это народная переделка имени Аполлон. В православных святцах имя Аполлон встречалось редко, но в быту его могли искажать до Апуник, Апунич, Апунов. Вторая версия — прозвище от диалектного слова «апуня», которое в некоторых говорах означало «опунья» или «апунья» — нечто вздутое, одутловатое, либо относилось к человеку медлительному. Однако эта версия менее надёжна: слово не зафиксировано в словарях как широкоупотребительное.

Нельзя исключать и искусственное происхождение. Фамилии на -ик нередко давали в семинариях: от латинского «apunctus» (отмеченный точкой) или греческого «апуник» (безупречный) — но это область догадок без документальных свидетельств. В польской ономастике есть фамилия Apuniewicz, что указывает на возможную шляхетскую или мещанскую основу.

В России фамилия Апуник встречается единично, в основном на юге и западе — в Краснодарском крае, Ростовской области, а также в Беларуси. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они происходили из крестьянской или мещанской среды, а саму фамилию записал священник или писарь «на слух» — от прозвища или искажённого имени.