Фамилия Арагилян — почти наверняка армянского происхождения, что выдают суффикс -ян и структура основы. В армянской ономастике формант -ян (в старой орфографии -янц) — патронимический, то есть указывает на принадлежность к роду: буквально «из рода такого-то» или «сын такого-то». В русской среде фамилии на -ян обычно не склоняются, хотя в самом армянском языке склонение по падежам есть.

Основная сложность — в корне «Арагил». Самая прямая и правдоподобная версия связывает его с армянским словом «арагил» (арм. աղաւնի) — «голубь». В этом случае Арагилян — потомок человека, которого прозвали Голубем. Прозвища по птицам в армянской среде встречаются: они могли указывать на внешность (светлые волосы, мягкий нрав), род занятий (голубятник) или быть чисто ласкательным. Фонетически версия безупречна: в армянском «голубь» звучит именно как «арагил» или «ахавни» в зависимости от диалекта, и форма «Арагилян» — это именно патроним от прозвища.

Есть и менее очевидная версия — от топонима. В исторической Армении существовало множество селений с корнем «Арагил» или близким «Аракел». Например, в Западной Армении (ныне территория Турции) есть местность Арагил, и фамилия могла образоваться по названию места жительства: «тот, кто из Арагила». Однако для топонимических фамилий в армянском чаще используют формант -ци (например, Ереванци — из Еревана), а -ян — всё-таки показатель рода, что делает «птичью» версию предпочтительнее.

В дореволюционных записях фамилия могла писаться через «о» — Орогилян, что связано с особенностями передачи армянских гласных в русской транскрипции XIX века. Встречается она преимущественно среди потомков выходцев из Западной Армении (исторические области Васпуракан, Туруберан), которые после геноцида 1915 года расселились по всему миру. В современной России и странах СНГ Арагиляны живут в Краснодарском крае, Ростовской области и Москве.

Так что, скорее всего, предки носителя этой фамилии получили прозвище за сходство с голубем — кроткие, мирные или, наоборот, ворковавшие без умолку. Точнее сказать без генеалогического исследования нельзя, но «птичий» след — самый надёжный.