Фамилия Аршунин — одна из тех, где за простым на первый взгляд звучанием скрывается неочевидная основа. Если разложить её по словообразовательной модели, сразу заметна редкость суффикса. Большинство русских фамилий на -ин образованы от основ, оканчивающихся на -а или -я (Иван — Иванов, но Кузьма — Кузьмин). Здесь же суффикс -ин присоединён к основе, которая заканчивается на согласный: Аршун-. Такая модель встречается реже и обычно указывает на то, что основа — не полное имя, а прозвище или усечённая форма.

Самая правдоподобная версия связывает фамилию с тюркским или кавказским корнем. В тюркских языках «аршун» или «аршын» — это мера длины (аршин), а также могло быть прозвищем человека высокого роста или того, кто торговал тканями, отмеряя их аршином. В азербайджанском, кумыкском и некоторых других языках слово «аршун» (или «аршын») означает именно «локоть» как меру. Фамилия могла закрепиться за отцом или дедом, которого в округе знали как Аршуна — либо по ремеслу (торговец мануфактурой), либо по внешнему признаку (длинный, как аршин проглотил).

Менее вероятная, но допустимая версия — от православного имени Арсений через народную форму Аршун. Усечение имени до Аршун (Арсений → Арсен → Арша → Аршун) встречается в южнорусских и украинских говорах, где любили сокращать имена до двух-трёх слогов. Однако эта гипотеза слабее: для неё нет устойчивой диалектной традиции, а суффикс -ун в русских прозвищах чаще образует названия по действию (бегун, крикун), чем уменьшительные формы.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Поволжью — регионам, где исторически сильны тюркские влияния. Встречается она нечасто, что говорит о локальном происхождении: род мог возникнуть в одном селе или городке и долго не рассеивался. Интересно, что в старых переписных книгах XVII–XVIII веков встречаются однокоренные фамилии Аршунов и Аршинов, но Аршунин — более редкий вариант, сохранивший именно прозвищную форму без перехода в патроним на -ов.

Таким образом, предки носителя фамилии Аршунин с высокой вероятностью были людьми, связанными с измерением или продажей тканей, либо получили прозвище по росту. В любом случае, фамилия — живой след южнорусского или поволжского быта, где тюркское слово прочно вошло в обиход и дало начало новому родовому имени.