Фамилия Атаген — редкий случай, когда написание почти зеркально отражает тюркское произношение, хотя корень, скорее всего, арабский. Основа «ата» в тюркских языках означает «отец», «предок» или «дед», но в этой фамилии она работает не сама по себе, а в паре со второй частью — «ген». Вместе это звучит как «ата-ген», что с тюркского переводится как «отцовский род» или «предок-родственник». Есть и другая версия: «Атаген» — искажённое Атабек или Атагян, где «ата» — тот же «отец», а «ген» восходит к тюркскому «гена» (щека, бок) или персидскому «хан» (владыка). В любом случае, фамилия указывает на уважаемого старшего в роду.

Словообразовательная модель здесь простая, но нетипичная для русских фамилий. Суффикс отсутствует — фамилия застыла в форме чистого прозвища или имени. В русской традиции такие фамилии чаще всего встречаются у народов Кавказа и Поволжья, где тюркские имена не получали славянских окончаний -ов или -ин. Если бы фамилия русифицировалась, она звучала бы как Атагенов или Атагенин, но этого не произошло — носители сохранили исходную форму. Это говорит о том, что фамилия закрепилась в среде, где русский язык был вторым или официальным, но не бытовым.

Географически фамилия Атаген редкая, но встречается среди кумыков, ногайцев, азербайджанцев и крымских татар. В России её можно найти в Дагестане, Ставропольском крае и Астраханской области. В дореволюционных метрических книгах она почти не фиксируется — скорее всего, фамилия оформилась уже в советское время, когда представителям малых народов начали массово записывать фамилии по паспорту. До этого носители могли именоваться просто по отцу: Атаген оглы (сын Атагена).

Важный нюанс: не путайте с армянской фамилией Атагян, где суффикс -ян указывает на принадлежность к роду. В фамилии Атаген такого суффикса нет, и это дополнительный аргумент в пользу её тюркского происхождения. Если ваш предок носил фамилию Атаген, он, вероятно, происходил из тюркоязычной мусульманской среды, где имя Атаген давали старшему сыну или внуку в честь деда — как знак продолжения рода.