Фамилия Атнюхин — редкая и неочевидная. На первый взгляд её основа кажется иноязычной, но, скорее всего, перед нами результат местного говора: «акающего» произношения или диалектной переделки. Самый вероятный источник — прозвище Отнюха, то есть человек, который «отнюхивает», принюхивается. В русских говорах глагол «нюхать» имел и переносные значения: разузнавать, выведывать, быть подозрительным. Прозвище Отнюха могли дать любопытному, дотошному человеку или тому, кто работал с обонянием, — например, знахарю, определявшему травы по запаху, или псарю, следившему за собаками.

Фамилия образована по стандартной модели: прозвище Отнюха → притяжательное прилагательное Отнюхин (чей? — сын Отнюхи) → со временем фамилия Атнюхин. Переход начального «О» в «А» — типичная черта южнорусских и среднерусских говоров (аканье). В документах XVII–XVIII веков фамилия могла писаться и как Отнюхин, и как Атнюхин, пока не закрепился современный вариант.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркским корнем «ат» (лошадь, имя) и суффиксом «-нюх», но убедительных параллелей в тюркской ономастике нет, и эта гипотеза слабее. Также не стоит путать Атнюхина с фамилией Атюнин (от имени Атя, уменьшительного от Афанасий) — здесь другой суффикс и другая основа.

Ареал фамилии узок. Основные носители встречаются в Поволжье, особенно в Нижегородской области и Мордовии. Это косвенно подтверждает диалектную версию: в этих краях аканье и местные говоры давали много фамилий с заменой «о» на «а». Сословно Атнюхины, скорее всего, крестьяне или однодворцы, то есть фамилия не дворянская и не купеческая, а народная, закрепившаяся в среде, где прозвища передавались по наследству.

Если ваши предки носили эту фамилию, ищите их в метрических книгах и ревизских сказках Нижегородской губернии — там шанс найти ранние упоминания выше.