Фамилия Аточкина — женская форма, мужская — Аточкин. В её основе лежит нецерковное имя или прозвище Аточка. Само слово «аточка» в русских говорах имело несколько значений. В северных и вологодских диалектах так называли небольшую изгородь или загородку для скота, что-то вроде загона. В других областях «аточка» могла означать «петля» или «завязка», а также — редкое, но фиксируемое значение «детская игра». Скорее всего, прозвище Аточка дали человеку, который занимался изготовлением таких изгородей или, метафорически, был «замкнутым», «стеснённым» в поведении. Вторая версия, менее вероятная, но допустимая: Аточка — это уменьшительная форма от крестильного имени Афанасий (через народную форму Атоня, Атоха). В этом случае фамилия образована по типичной модели: от имени через суффикс -к- и притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Аточки). Географически фамилия Аточкины встречается в основном в центральной России и Поволжье, что указывает на её происхождение из среды крестьян и посадских людей, где прозвища по роду занятий или бытовым чертам были особенно распространены.