Фамилия Атоянц — это классический пример того, как суффикс «переезжает» вместе с носителем. Она образована по армянской модели с суффиксом -янц (или -ян) и указывает на происхождение от предка по имени Ато. В самой Армении фамилия чаще звучала бы как Атоян, но форма на -янц характерна для армян, живших на Кубани, в Ростовской области или в Крыму. Этот суффикс — диалектная или «западная» версия того же -ян, и он прижился среди армянских общин, оказавшихся на территории Российской империи ещё в XVIII–XIX веках.

Основа фамилии — личное имя Ато. В армянском ономастиконе это краткая форма от имён Атом или Атонес (армянский вариант Иоанна, то есть Ивана). Атом — имя древнее, в том числе мифическое: в армянском эпосе так звали одного из легендарных прародителей. Но в быту Ато могло быть и просто уменьшительным от более длинных христианских имён, а в некоторых случаях — самостоятельным прозвищем.

Таким образом, Атоянц — не ремесленная и не топонимическая фамилия, а чисто патронимическая. Она отвечает на вопрос «чей?»: сын или потомок Ато. Если сравнивать с русскими фамилиями, то по механизму образования она ближе всего к «Иванов» или «Петров», только с другим суффиксом.

Встречается она нечасто, и это не случайно: форма на -янц в целом менее распространена, чем на -ян. В дореволюционных метрических книгах и переписях Атоянц могли записать и как Атоян, и как Атоянц, в зависимости от того, где жила семья и как привык писать писарь. Поэтому, если искать предков, стоит проверять оба варианта написания — особенно по югу России и Ставрополью.

Социальный состав носителей неоднороден: среди Атоянц были и крестьяне, и купцы, и ремесленники. Фамилия не указывает на сословие, а только на имя родоначальника. Но в армянской среде фамилия на -янц часто выдаёт переселенцев из Западной Армении (с территории современной Турции), где эта форма была особенно распространена.