Фамилия Айдарканов — редкий случай, когда прозвище, ставшее фамилией, почти наверняка указывает на конкретное место, а не на личное качество или профессию. Её основа — тюркское слово «айдар» (или «айдарка»), которое в разных регионах имеет два основных значения: «хохол», «чуб» (оставленная на макушке прядь волос у казахов, башкир, татар) и «гребень», «холм», «возвышенность». Словообразовательная модель подсказывает, что перед нами не просто фиксация внешности.

Суффикс «-ов» — стандартный русский патронимический формант, но в данном случае он присоединён не к личному имени, а к прозвищу Айдаркан. Уменьшительно-уничижительный суффикс «-кан» (сравните с татарскими и башкирскими именами типа Айдархан, где «-хан» — титул, а «-кан» — скорее ласкательная или пренебрежительная форма) превращает «айдар» в «айдарка» — «маленький чубчик» или «небольшой холмик». Таким образом, цепочка выглядит так: прозвище Айдарка (человек с чубом или живший на холме) → Айдаркан (уменьшительное) → Айдарканов («сын Айдаркана»).

Версия с географической привязкой кажется более правдоподобной для такой фамилии. В Башкортостане и Татарстане известно несколько топонимов с корнем «айдар» — названия деревень, речек, урочищ. Человек, переселившийся из деревни Айдар или с урочища Айдарка, легко получал прозвище Айдарка, которое затем закрепилось за его потомками. В пользу этого говорит и редкость фамилии: если бы она происходила от распространённого имени или прозвища, её носителей было бы больше, а так она осталась локальной, привязанной к небольшой территории.

Версия о происхождении от тюркского имени Айдар (распространённого у казахов, киргизов, башкир) возможна, но менее убедительна. Имя Айдар давалось мальчикам с пожеланием силы и мужества (дословно — «лунный», «сияющий»), но тогда фамилия должна была звучать как Айдаров или Айдарханов. Усложнение формы через «-кан» и «-ов» выглядит как вторичная русификация местного прозвища, а не прямого имени.

Социальный контекст фамилии — однозначно крестьянский или казачий. Айдаркановы, скорее всего, происходят из башкирских, татарских или казахских родов, которые в XIX — начале XX века при переписях получали фамилии по прозвищу главы семьи. Фамилия не дворянская, не купеческая — её носители были либо государственными крестьянами, либо казаками Оренбургского или Уральского войска, где тюркские элементы в фамилиях не редкость.