Фамилия Айдогдыева образована от мужского имени Айдогды, которое состоит из двух компонентов: «ай» и «догды». В древнетюркском языке слово «ай» (буквально - «месяц») имело переносные значения: «красивый, ценный; святой», «чистый, светлый, лучистый», «умный», «дорогой», «обильный», «счастливый» и др. Компонент «догды», по одной из версий, восходит к киргизскому слову «дагды» - «навык, привычка». Однако не исключено, что вторая часть имени Айдогды связана со словом «догдо» - «толпиться, собираться в кучу». В таком случае имя Айдогды могли дать ребенку в семье, где было много мальчиков. Следует отметить, что имя Айдогды является довольно редким и встречается в основном в странах Средней Азии. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Айдогдыевых можно лишь на основании генеалогических исследований.