Фамилия Аймакенов прозрачна настолько, насколько это вообще возможно для редкого тюркского имени: русский суффикс -ов просто указывает на принадлежность («сын Аймакена»), а всё смысловое ядро — в личном мужском имени Аймакен. Но именно этот корень уводит вглубь тюркской географии и социальной структуры кочевников.

Первая часть имени — «ай» — по-тюркски «луна», но в антропонимике она редко означает небесное тело в прямом смысле. Чаще это компонент со значением «красивый, светлый, чистый»; в некоторых контекстах — даже «святой». Вторая часть «макен» сложнее. Скорее всего, это диалектный или исторический вариант слова «макан» (в казахском, киргизском, каракалпакском языках — «кочевье, стоянка, место жительства, становище»). Получается, Аймакен могло означать «светлое кочевье», «красивая стоянка» или «чистое место». Менее вероятно, что «макен» восходит к арабскому «макин» (прочный, крепкий, влиятельный), — для кочевой среды семантика «места» органичнее и ближе к бытовой реальности.

По модели образования фамилия типична для тюркских народов России и Казахстана: к основе-имени добавили русский суффикс -ов, который в XIX–XX веках стал стандартным способом русификации фамилий при записи в метрики и паспорта. Носитель фамилии Аймакенов — потомок человека по имени Аймакен. Сам же Аймакен мог получить имя по месту рождения или стоянки рода, либо это прозвище, закрепившееся за основателем семьи.

Фамилия редкая, её география, скорее всего, привязана к Казахстану (особенно южные и западные области) и прилегающим регионам России, где живут казахи. Встречаемость крайне мала — это говорит о локальном происхождении, возможно, от конкретного рода или аула. Сословная принадлежность предков не определяется: фамилию на -ов могли получить и рядовые скотоводы, и представители знати при переходе на оседлость и оформлении документов.

Интересная деталь: в отличие от фамилий на -ев (от основ на мягкий согласный), суффикс -ов здесь стоит после твёрдого «н». Если бы имя звучало как Аймакене, фамилия была бы Аймакенев. Это лишний раз подтверждает, что исходное имя — именно Аймакен, а не заимствованная форма с мягким окончанием.