Фамилия Айтупов — один из примеров, где очевидная тюркская основа сочетается с типично русским суффиксом, что сразу указывает на время и способ её появления. Разбираем по частям: корень «Айтуп» и окончание «-ов». Первая часть — это личное имя Айтуп, которое в тюркских языках (казахском, башкирском, татарском) складывается из двух слов: «ай» (луна, месяц) и «туп» или «тубып» (стоять, находиться, а также в переносном смысле — «подобный луне», «луноликий»). Встречается также версия, что «туп» — это вариант слова «төп» (корень, основа), и тогда имя осмысляется как «корень луны» или «лунное начало», но это менее распространённое толкование.

Суффикс «-ов» — классический русский патронимический формант, который в XVI–XIX веках массово присоединяли к нерусским именам при оформлении фамилий в документах. Это значит, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крещёным татарином, башкиром или казахом, получившим при крещении имя Айтуп (или носившим его как мирское), а его дети уже записывались как Айтуповы. Географически фамилия чаще всего встречается в Оренбургской, Челябинской областях и в Башкортостане — регионах, где исторически смешивались тюркское и русское население.

Интересная деталь: в отличие от многих тюркских фамилий на «-ов», где основа легко читается как прозвище или профессия (например, Бекмурзов — от титула «бек»), имя Айтуп — скорее поэтическое, восхваляющее. Такие имена давали в надежде на красоту или удачу ребёнка. Прямых аналогов среди русских фамилий нет, но по модели образования Айтупов стоит в одном ряду с Айбатовыми, Айсинскими — все они от имён, начинающихся на «ай-», что в тюркской ономастике очень продуктивно.

Встречаются варианты написания с одной «п» — Айтупов, и с двойной — Айтуппов. Двойное написание, вероятно, результат ошибки в паспортных столах XX века, когда фамилию механически удлинили по аналогии с русскими фамилиями вроде Степпова (от Степпа). Но исходная форма — с одной «п», так как в тюркском имени удвоения согласных нет. Фамилия редкая, в общероссийских списках не входит в первую тысячу, что делает её хорошим маркером для генеалогического поиска — сужаешь круг до конкретной семьи или нескольких родов в одном регионе.