Фамилия Бабаян-Истомина — составная, двойная. Она образовалась в результате слияния двух фамилий: армянской Бабаян и русской Истомина. Чаще всего так происходит при заключении брака, когда каждая из сторон (жених и невеста) желает сохранить свою родовую фамилию.

Первая часть, Бабаян, — типично армянская. На это указывает суффикс -ян, который в армянском языке означает принадлежность к роду. В основе же лежит имя или прозвище Баба. Здесь возможны разные корни. В арабском языке «баба» означает «отец, батюшка», и это имя могло прийти вместе с мусульманским влиянием. Но в армянской среде Баба могло быть и просто ласковым обращением к отцу, и самостоятельным мирским именем. Так что фамилия Бабаян буквально означает «из рода того, кого звали Баба».

Вторая часть, Истомина, — русская фамилия. Она восходит к нецерковному мужскому имени Истома. В Древней Руси это имя было весьма распространено. Его давали не при крещении, а в быту, и часто — беспокойному, капризному ребенку, который «истомил» родителей своим нравом. В древних русских документах зафиксировано большое количество людей с таким именем. Фамилия Истомина образована по стандартной модели: от имени Истома через притяжательное прилагательное (чей? — Истомин) с окончанием -а для женского рода. Таким образом, Истомина — это «дочь или жена Истомы».

Интересно, что в этой двойной фамилии соединились две совершенно разные ономастические традиции: армянская модель на -ян и русская модель с суффиксом -ин. По сути, это фамильный «мост» между двумя культурами. Потомок человека, носившего мирское имя Баба с одной стороны, и потомок Истомы — с другой, со временем получил фамилию Бабаян-Истомина, закрепившую память о двух разных предках в одной строке.