Фамилия Бабенышев (встречается и вариант написания через «ё» — Бабёнышев) образована от личного прозвища Бабеныш (Бабёныш). Это классическая русская фамилия, построенная по модели «прозвище + патронимический суффикс -ев»: сын Бабеныша со временем стал Бабенышевым.

Разобраться с тем, что означало исходное прозвище, непросто — у слова «баба» в славянских языках слишком много значений. Одна из версий отталкивается от украинского нарицательного «баба» — «тяжелый подвесной молот для забивки свай». В этом случае Бабенышем могли прозвать человека крупного, сильного, занятого на строительстве. Та же лексема в украинском обозначает и «род печенья из пшеничной муки», и «сорт крупных груш». Значит, прозвище могло закрепиться за пекарем, садоводом или просто за рослым и могучим предком — в любом случае оно подчеркивало физическую мощь, настойчивость и силу воли.

Другая, более бытовая версия, связывает прозвище с ласкательным обращением к бабушке или пожилой женщине. Тогда Бабёнышем называли внука, которого бабушка воспитывала, или её любимца. Третья гипотеза ведет прозвище от украинского «бабій» — «изнеженный, нерешительный мужчина». В этом случае прозвище отражало не столько профессию или внешность, сколько особенности характера.

Какая из версий верна для конкретной семьи Бабенышевых, сказать без генеалогического исследования невозможно. Процесс формирования фамилий был длительным, и одна и та же фамилия могла возникнуть в разных местах по разным причинам. Ясно одно: фамилия Бабенышев — живой памятник славянской культуры, в котором сохранилось одно из многочисленных прозвищ, данных предкам по работе, внешности или семейному положению.