Фамилия Баембитов образована от тюркского мужского имени Бейимбет. В основе этого имени лежат два корня: «бей» (князь, правитель, господин) и «мбет», восходящий к арабскому «мухаммад» (восхваляемый, прославленный). Таким образом, имя Бейимбет можно истолковать как «князь Мухаммад» или «правитель, достойный хвалы». Чередование гласных в фамилии — «е» перешло в «а» — скорее всего, вызвано влиянием фонетики татарского и казахского языков, где звук «э» или «е» в безударной позиции мог редуцироваться и заменяться на более открытый «а». Это типичный пример адаптации арабо-тюркского имени в устной речи кочевых народов.

Суффикс -ов указывает на русскую модель оформления фамилий, которая закрепилась у многих тюркских народов в XIX–XX веках, особенно в среде казахов, татар и башкир. Первоначально Баембитовы — это потомки человека по имени Бейимбет, то есть фамилия означает «принадлежащий к роду Бейимбета». Географически фамилия чаще всего встречается среди казахов (особенно в Западном Казахстане) и у татар, что подтверждает её степное происхождение.

В дореволюционную эпоху носители такой фамилии могли относиться к сословию «черной кости» (простых скотоводов), но само имя указывает на уважение к предку, которого называли княжеским именем — возможно, за богатство, воинскую доблесть или мудрость. В ономастических трудах, например в работах А. Суперанской, отмечается, что составные имена с компонентом «бей» были распространены у тюркских народов как знак высокого статуса или пожелания власти. Фамилия Баембитов — не просто родовое прозвище, а отражение сложного сплава арабской исламской традиции и тюркской социальной иерархии, зафиксированное в русской паспортной форме.