Фамилия Баембетов — тюркская по происхождению, и её разбор стоит начать с имени, лёгшего в основу. Это патронимическая фамилия, образованная по русской модели с суффиксом -ов от личного имени Баембет. Само имя составное, типичное для тюркской антропонимии: первая часть «бай» означает «богатый, господин, хозяин», вторая — «мбет» восходит к арабскому «мухаммад» (прославленный, достохвальный) через тюркское произношение, где «м» часто переходит в «б». Таким образом, Баембет — это «богатый (или господин) Мухаммад», имя, которое давали в честь пророка, но с пожеланием достатка и уважения.

Географически фамилия Баембетов тяготеет к регионам, где исторически жили башкиры, татары и казахи. Встречается она прежде всего в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях. В тюркской среде такие фамилии часто указывали на род, где предок носил это имя, но не обязательно был знатного происхождения — «бай» в имени могло быть просто частью пожелательного имени, а не указанием на реальное богатство.

Интересная деталь: в отличие от многих русских фамилий на -ов, где ударение падает на последний слог, в фамилии Баембетов ударение чаще всего ставят на второй слог — Бае́мбетов. Это выдает её нерусское происхождение: ударение сохраняется на той же позиции, что и в исходном имени Баембе́т. В документах XIX — начала XX века можно встретить варианты написания через «а» — Баямбетов, что связано с особенностями произношения в разных диалектах.

Сословно носители фамилии относились к разным группам. В башкирских и татарских деревнях это были тептяри, государственные крестьяне или служилые люди. В метрических книгах Оренбургской губернии конца XIX века Баембетовы записаны как «башкиры-вотчинники» — то есть коренные жители, владевшие землей на правах общины. Никакого дворянства за этой фамилией не числится, что типично для большинства тюркских патронимов, не попавших в российское табельное сословие.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Баембетов, Баймухаметов, Байбеков — показывает, что все они построены по одной схеме: личное тюркское имя плюс русский суффикс. Но Баембетов стоит особняком из-за стяжения: «Мухаммад» сократился до «мбет», что реже встречается в письменных источниках, чем полная форма «мухаммет». Это может говорить о том, что имя бытовало в устной традиции, в среде, где арабская письменность была не так распространена.