Фамилия Баерский — относительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, это вариант фамилии Баерский (с ударением на «а» или «е»), который указывает на два возможных корня: географический или немецкий.

Первый и самый очевидный путь — от названия населённого пункта. В Польше, Беларуси и на западе Украины есть несколько мест с корнем «Бар» или «Баер» (например, Бары, Баер). Суффикс -ский в русских и польских фамилиях — типичный «дворянский» или шляхетский маркер. Он указывал на принадлежность к месту: «тот, кто из Баера». Так фамилию мог получить помещик, владевший имением, или его слуга, переехавший в другой регион.

Второй, не менее вероятный сценарий — немецкое происхождение. Фамилия могла быть русификацией немецкой Bayer (Баер, то есть «баварец»). В XVIII–XIX веках в Россию приезжало много немецких специалистов (врачей, инженеров, офицеров), и их фамилии нередко получали окончание -ский для благозвучия или при переходе в дворянство. Так «Баер» превращался в «Баерского». В пользу этой версии говорит и то, что в некоторых старых документах фамилию писали через «е» — Баерский, что ближе к немецкому произношению.

Интересная деталь: в русском языке фамилия часто путается с более известной Баевский или Баер, но её отличает именно окончание -ский, которое в XIX веке часто давали выходцам из духовенства. Если предок Баерского был священником, его могли «переделать» в семинарии из простой фамилии Баер (от слова «баять» — говорить, или от немецкого корня) в более статусную форму. Однако точных данных о сословной принадлежности всех носителей нет — фамилия встречается и в крестьянской, и в мещанской среде.

Спорный момент: иногда Баерского пытаются связать с тюркским словом «бай» (богатый), но это натяжка — суффикс -ский нехарактерен для тюркских языков, а корень «баер» в таком случае не объясним. Правдоподобнее всего остановиться на двух версиях — топонимической (от названия места) или немецкой (от прозвища «баварец»).