Фамилия Бафтрель стоит особняком в русском ономастиконе — её происхождение неочевидно, а состав не укладывается в привычные модели русских фамилий. В ней нет типичных суффиксов принадлежности (-ов, -ин, -ский), нет указания на отчество или место жительства. Это прямо указывает на то, что перед нами не исконно русская фамилия, а заимствованная или искусственная, причём довольно поздняя.

Наиболее вероятная версия связывает Бафтрель с французским языком. Основа может восходить к французскому слову «bâton» (палка, жезл) или «bat» (вьючное седло) в сочетании с суффиксом «-el», образующим уменьшительные или характеризующие формы. Однако более правдоподобна другая линия: фамилия могла возникнуть от прозвища «Bâtard» (бастард, внебрачный ребёнок), которое в русской транскрипции и под влиянием народной этимологии превратилось в Бафтрель. Переход «д» в «ф» и замена окончания — типичное для устной передачи искажение, когда непонятное слово «переделывали» на более привычный лад.

В России фамилия Бафтрель встречается крайне редко и имеет чёткую географическую привязку — в основном к южным регионам и бывшим губерниям, где в XVIII–XIX веках оседали иностранные специалисты, военнопленные или гувернёры. Носители такой фамилии могли быть выходцами из обрусевших французов, швейцарцев или бельгийцев, которые поступили на русскую службу. В дворянских родословных книгах эта фамилия не фигурирует; скорее всего, её обладатели относились к городским сословиям — мещанам, купцам или разночинцам.

Словообразовательный разбор показывает, что фамилия не прошла через стандартную русскую модель патронимии. Если бы её «обрусели» в XIX веке, она могла бы принять форму Бафтрелев или Бафтрельский, но этого не произошло. Сохранение исходного окончания — признак того, что фамилия закрепилась в документах уже в готовом, иноязычном виде и не подверглась адаптации. Таким образом, Бафтрель — это не прозвище, ставшее фамилией, а скорее фамилия-«иностранец», которую предки получили при переезде или при записи в метрические книги.