Фамилия Бавтрель — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от тысяч фамилий на -ов и -ин, образованных от крестильных имён, эта стоит особняком. Скорее всего, перед нами фамилия польского или белорусского корня, попавшая в русский язык через западные регионы. Основа «Бавтр-» — это искажённое «Бартоломей» (в польской традиции — Bartłomiej). В польских говорах и особенно в белорусском языке имя нередко сокращали до форм вроде Бавтрук, Бавтромей, а суффиксальная часть «-ель» указывает на уменьшительно-ласкательное или патронимическое образование.

Вероятнее всего, Бавтрель — это фамилия, которая закрепилась за потомком человека по прозвищу Бавтрель, то есть «маленький Бартоломей» или «сын Бартоломея». Такая модель типична для польских фамилий с суффиксом -el (ср. Войцех — Войцель, Павел — Павель). В русском же языке суффикс -ель встречается редко и почти всегда заимствован. Если бы фамилия была исконно русской, мы бы ждали окончание -ов или -ев.

Другая, менее правдоподобная версия связывает фамилию с немецким диалектным словом Bauträger (строитель, подрядчик), но фонетически Бавтрель от него далека. Скорее всего, носители фамилии — выходцы из западнорусских земель (современные Беларусь, Подляшье, Смоленщина), где польское влияние на антропонимику было сильным. Фамилия не получила широкого распространения и осталась локальной, что делает её особенно интересной для семейной истории: предки Бавтрелей почти наверняка жили на стыке культур, где имя Бартоломей звучало по-своему, а фамилия записывалась на слух, без строгой книжной нормы.