Фамилия Багабанов — одна из тех, где корень не сразу бросается в глаза, а суффикс подсказывает регион происхождения. Основа здесь — тюркское личное имя или прозвище Багабан. В языках тюркской группы «бага» означает «лягушка», а «бан» — суффикс принадлежности или профессии. Таким образом, Багабан могло быть прозвищем человека, связанного с лягушками: возможно, ловца, знахаря, использовавшего их в снадобьях, или просто обладателя хриплого, «квакающего» голоса. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с монгольским «бага» («маленький»), тогда прозвище означало бы «младший» или «малыш».

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий от отчества или прозвища отца. В данном случае Багабанов значит «сын Багабана». Такая фамилия могла возникнуть в среде, где русские писцы или священники адаптировали тюркское именование под привычную форму: к основе добавили фамильный суффикс, а гласные подогнали под русское произношение. Это типично для Поволжья, Урала и южных регионов — мест активных контактов с татарами, башкирами, казахами.

Интересно, что фамилия редкая и не попала в массовые справочники вроде словаря Унбегауна. Её носители встречаются в основном в Оренбургской области и Башкортостане, что подтверждает тюркские корни. Сословно предки могли быть государственными крестьянами или казаками — в этих группах охотно заимствовали прозвища из местных языков.

У фамилии есть вариант написания с одной «а» — Багабанов (ударение чаще на последний слог). Двойное «а» в середине — результат стяжения при адаптации: исходное «Багабан» дало «Багабанов», а не «Багабанов». Кстати, однокоренные фамилии вроде Багаев или Багаутдинов встречаются чаще и тоже ведут начало от тюркских «бага» или «баха» (устойчивый, крепкий), но Багабанов стоит особняком из-за редкого суффиксального оформления.