Фамилия Баигереев — тюркская по происхождению, и разобрать её стоит, начав с основы. В ней отчётливо выделяется корень «баигер» (или «байгер») и русский патронимический суффикс «-ев», указывающий на принадлежность («чей?» — Баигереев). Такая модель типична для фамилий, которые в XIX — начале XX века получали крещёные тюркские народы (казахи, татары, башкиры, ногайцы), когда к личному имени или прозвищу добавляли русское окончание.

Основа «Баигер» — сложносоставное тюркское имя. Первая часть «бай» означает «богатый», «могущественный», «господин». Вторая часть — «гер» (или «йер») восходит к древнетюркскому «ер/ир» — «мужчина», «воин», «герой». Таким образом, Баигер — это «богатырь» или «знатный муж», то есть имя-пожелание, распространённое у кочевых народов. Встречаются и параллельные формы: Баигерев, Баигиров, Баигеров, что объясняется особенностями записи тюркских звуков в русских документах.

Географически фамилия привязана к регионам, где проходили активные контакты русского и тюркского населения — Оренбургская, Астраханская губернии, Башкортостан, северо-западный Казахстан. В этих местах фамилия фиксируется с конца XIX века. Интересно, что имя Баигер почти не встречается как самостоятельное личное имя в современных тюркских языках — оно архаичное, вытесненное более поздними арабскими и персидскими заимствованиями. Это делает фамилию Баигереев своего рода лингвистическим «ископаемым», сохранившим древнюю тюркскую лексическую модель.

Сословно носители фамилии, скорее всего, относились к государственным крестьянам или казакам (в Оренбургском казачьем войске), так как именно эти группы активно принимали православие и получали фамилии по имени отца. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» или «Общем гербовнике» не числится.