Фамилия Бакдаевы — редкая, и её происхождение неочевидно. На первый взгляд в ней слышится что-то восточное, тюркское или кавказское, и это первая нить, за которую стоит потянуть.

Основа фамилии — «Бакдай». Скорее всего, это не славянское имя или прозвище, а адаптированное тюркское слово или имя. В тюркских языках есть корень «бак» — смотреть, глядеть, а также «бак» в значении «достаток», «счастье». «Бакдай» могло быть прозвищем зоркого, внимательного человека или, что вероятнее, вариантом личного имени Бахдай или Бактай. У народов Поволжья и Кавказа имена с компонентом «бай» (господин, богач) были распространены: Бактай, Бахдай. В таком случае Бакдай — это «богатый смотрящий» или «счастливый господин».

Фамилия образована по русской модели с суффиксом -ев: Бакдай → Бакдаев (чей сын? — Бакдаев). Суффикс -ев, а не -ов, указывает, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий звук (в данном случае на «й»). Это стандартная русификация нерусского имени.

Географически фамилия Бакдаевы тяготеет к регионам, где смешивались славянское и тюркское население. Её можно встретить в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области, а также среди кавказских народов, где фамилии на -ев пришли вместе с русской администрацией. Второй возможный, но менее вероятный корень — от арабского «бакдад» (Багдад), но для прозвища «Багдаец» более типична форма Багдаев.

Род Бакдаевых, скорее всего, не принадлежал к дворянству — фамилия не встречается в родословных книгах Российской империи. Это фамилия крестьян, казаков или мещан, получивших её при переписях или при переходе в православие от тюркского имени. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок носителя этой фамилии имел имя или прозвище Бакдай, и его потомки закрепили это имя в качестве родового знака.