Фамилия Бахницкий звучит как типичная фамилия польского или западнорусского происхождения, образованная по модели с суффиксом -цкий/-ский. Если отбросить суффикс, остаётся основа «Бахниц-», которая, скорее всего, восходит к названию населённого пункта. В Польше и на территории бывшей Речи Посполитой существовали и существуют топонимы вроде Бахница, Бахничи или Бахново. Человек, переселившийся из такого места, получал прозвище по месту выхода — Бахницкий, то есть «тот, кто из Бахниц». Такая модель характерна для шляхетских фамилий, но могла закрепиться и у крестьян или мещан после разделов Польши, когда фамилии стали обязательными для всех сословий.

Корень «Бах-» в славянских языках неоднозначен. В польском «bach» может означать звук удара или хлопка, а в диалектах — нечто вроде «бахвал» или «хвастун». Однако для фамилии Бахницкий более вероятна связь с личным именем или прозвищем Бахно (уменьшительное от Богдан или Борис, как Бахно = Божко). В таком случае Бахницкий — это «сын или потомок Бахна». Третья версия отсылает к древнепрусскому или балтскому корню «baka» (ручей, болото), что тоже могло дать название местности.

Фамилия редкая, в современных российских справочниках массово не встречается. Её носители — это, скорее всего, потомки выходцев из западных губерний Российской империи (Виленской, Гродненской, Волынской) или из современной Польши. В силу редкости фамилии можно предположить, что все Бахницкие могут быть родственниками, ведущими происхождение от одного предка, жившего в небольшом местечке. Ударение, по аналогии с другими фамилиями на -цкий, ставится на второй слог: Бахни́цкий.