Фамилию Баходиров чаще всего объясняют через тюркское мужское имя Бахтияр, что в переводе с персидского означает «счастливый», «удачливый», «богатый». Однако здесь важна деталь: в узбекском и таджикском языках имя Бахтияр в разговорной речи часто редуцировалось до формы Баходыр (Бахадыр). Именно этот сокращённый вариант и лёг в основу фамилии. Таким образом, Баходиров — это не «сын счастливого», а «сын Баходыра», то есть потомок человека, которого звали сокращённо от полного имени.

Словообразовательная модель прозрачна: к основе Баходир прибавляется русский патронимический суффикс -ов, который в тюркоязычных регионах (Узбекистан, Таджикистан, частично Казахстан) стал стандартным способом оформления фамилий в советский период. В отличие от исконно русских фамилий, где -ов указывает на отца, здесь он просто фиксирует родовое имя, передаваясь по наследству без изменений.

Есть и другая, менее распространённая версия: связывать фамилию с древнетюркским титулом «багатур» (богатырь, храбрец). В таком случае Баходир — это не имя, а прозвище, данное воину или силачу. Но эта гипотеза слабее, потому что в реальной антропонимии Средней Азии XX века форма «Баходир» почти всегда выступала именно как вариант имени Бахтияр, а не как прозвище.

Интересно, что в русских документах фамилия иногда писалась через «х» — Бахотиров, что отражает произносительную особенность: в узбекском языке звук [х] в позиции между гласными может смягчаться до [h], и на слух «Баходир» и «Бахотир» почти неразличимы. Такие варианты встречаются в переписях начала XX века, когда фамилии записывали на слух.

Социально носители фамилии Баходиров — это в основном потомки оседлого или полуоседлого населения Ферганской долины, Ташкента и Самарканда. В среде кочевников-скотоводов фамилии на -ов приживались реже. Сейчас это одна из распространённых узбекских и таджикских фамилий, которую носят люди самых разных профессий, без привязки к конкретному сословию предков.