Фамилия Баходирова — женская форма фамилии Баходиров, а та, в свою очередь, образована от личного имени Баходир. Это имя тюркского происхождения, восходящее к слову «бахадур» (batur, batyr), что означает «богатырь», «герой», «храбрец». В древнетюркском и монгольском языках это слово обозначало воина-витязя, прославленного в бою, и нередко входило в состав титулов знати. Таким образом, в основе фамилии лежит прозвище или имя, данное человеку с пожеланием силы и мужества.

Модель образования фамилии проста: к основе Баходир прибавили русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Такая схема типична для фамилий народов Средней Азии и Кавказа, которые оформлялись по русскому образцу в XIX–XX веках, особенно при документальной фиксации в паспортных столах Российской империи и СССР. Без суффикса имя Баходир осталось бы просто именем, а с суффиксом оно превратилось в фамилию, указывающую на принадлежность к роду человека по имени Баходир.

Стоит обратить внимание на орфографию: в русском языке фамилия пишется через букву «о» (Баходиров/Баходирова), хотя в узбекском и таджикском оригинале имя может звучать как «Баходур» или «Бахтиёр» (другое имя, с другим корнем). Фамилия Баходирова распространена прежде всего в Узбекистане, Таджикистане и среди выходцев из этих регионов в России. Встречается и вариант Баходырова, но он менее частотен и считается графической ошибкой при записи.

С точки зрения социальной истории, предки носителей фамилии вряд ли принадлежали к высшей аристократии: имя Баходир было популярно в среде ремесленников, торговцев и дехкан. Только в редких случаях его могли давать в подражание историческим личностям (например, полководцам прошлого), но в массе это было простое желание видеть сына сильным и здоровым. Фамилия не несёт указания на сословие или профессию — она чисто патронимическая, и её главный смысл: «дочь (или потомок) того, кого звали Баходиром».