Фамилия Бакихановы — одна из тех, что хранит в себе сразу два смысловых пласта: арабский и тюркский. В её основе лежит составное мусульманское имя Бакихан, которое разбирается на две части, каждая со своей историей.

Первая часть — Баки — восходит к арабскому слову «баки», что значит «вечный» или «живущий вечно». В исламской традиции это один из эпитетов Аллаха, но со временем слово перешло в разряд личных имён, что для мусульманского мира обычная практика. Вторая часть — хан — тюркского происхождения. Изначально «хан» означал вождя племени, особенно у кочевников Ирана и Афганистана, а позже закрепился как титул «властитель, монарх». В составных именах этот компонент указывал на пожелание ребёнку высокого положения, уважения и богатства.

Складываясь вместе, имя Бакихан несло двойное пожелание: чтобы мальчик прожил долгую, счастливую жизнь (от «вечного» Баки) и добился власти или авторитета (от «хана»). Фамилию Бакихановы, соответственно, образовали по русской модели с суффиксом -ов, отвечая на вопрос «чей?»: потомок человека по имени Бакихан.

С точки зрения словообразования это типичная фамилия-патроним, но с необычной восточной основой. В русском ономастиконе такие фамилии — памятник исламской культуры, проникший в российскую среду через народы Поволжья, Кавказа или Средней Азии. Точное время и место возникновения фамилии у конкретной семьи установить сложно: процесс закрепления фамилий у мусульманских народов Российской империи шёл неравномерно и растянулся на XIX — начало XX века. Окончательные выводы требуют серьёзных генеалогических изысканий, но общее значение и происхождение фамилии Бакихановы прослеживается достаточно ясно.