Фамилия Балаклеенко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели с суффиксом -енко. В украинской ономастике этот суффикс — самый распространённый: он указывал на сына или потомка человека, чьё имя или прозвище легло в основу. То есть Балаклеенко буквально означало «сын Балаклея» или «потомок Балаклея».

Сама основа — Балаклей — восходит к топониму. На Украине и юге России известны несколько населённых пунктов с названием Балаклея (в Черкасской, Харьковской областях, а также станица Балаклеевская в Ростовской области). Название этих мест, в свою очередь, связывают с тюркским словом «балакла» — «рыбное место» или «грязное место» (от «балык» — рыба, либо «балыклы» — рыбный). В украинских говорах «балаклея» могло означать и болотистую, топкую местность. Таким образом, первый носитель фамилии Балаклеенко, скорее всего, был выходцем из села или хутора Балаклея — его прозвали по месту жительства, а уже потом дети получили фамилию от этого прозвища.

Менее вероятна, но не исключена версия, что в основе лежит прозвище Балаклей от диалектного глагола «балакать» — говорить, болтать. Однако в таком случае ожидалась бы форма Балакенко или Балакаенко. Привязка к топониму выглядит убедительнее, тем более что фамилия Балаклеенко встречается преимущественно в регионах, где есть соответствующие географические названия: в Харьковской, Полтавской, Сумской областях, а также на Кубани, куда украинские переселенцы принесли и свои фамилии.

С точки зрения социального статуса, носители фамилии Балаклеенко относились к казацким или крестьянским родам. В реестрах Запорожского войска и в метрических книгах XVIII–XIX веков такие фамилии нередки среди казачьей старшины и простых казаков. В отличие от русских фамилий на -ов и -ин, украинское -енко долго не было закреплено за дворянством, а бытовало у всех сословий, поэтому по одной фамилии сословие предков определить трудно — нужно искать конкретные документы.

Интересная деталь: фамилия Балаклеенко — не единственная от этого корня. Существуют однокоренные Балаклей, Балаклеев, Балаклеевский, Балаклея. Все они объединены общей географической отсылкой, что делает их своеобразным «топонимическим гнездом». В современной Украине фамилия Балаклеенко нечастотна, но встречается стабильно, особенно в восточных и центральных областях.