Фамилия Балтушенков — один из тех случаев, когда географическое бытование помогает разобраться в происхождении быстрее, чем лингвистический разбор. Она редкая и сконцентрирована в основном на западе Брянской области и в прилегающих районах Белоруссии и Украины. Эта привязка к Полесью — ключ к разгадке.

В основе фамилии лежит прозвище или имя Балтуш, а оно, в свою очередь, — местная форма крестильного имени Валтасар. В православных святцах это имя встречается, но в народе его часто переделывали на свой лад: Балтазар, Балтуш. Форма на -уш характерна для западнорусских и украинских говоров (как Матюш от Матвей, Иванюш от Иван). Имя Валтасар библейское (один из вавилонских царей), но в крестьянской среде его давали не в честь царя, а по святцам — память мученика Валтасара приходится на несколько дней в году.

Суффикс -енков указывает на модель образования, типичную для восточноукраинских и южнорусских (особенно курско-орловских) фамилий. Первоначально Балтушенко — это «малый Балтуш» или сын Балтуша. Когда носители такой фамилии оказывались под властью Московского государства, к ней могли добавить типично великорусский суффикс -ов: так Балтушенко превратился в Балтушенкова. В документах XIX века эту фамилию могли записывать двояко — и как Балтушенко, и как Балтушенков, в зависимости от того, кто вёл запись и к какому сословию относился человек.

Менее вероятная, но не исключённая версия связывает основу с литовским или жемайтским словом baltus («белый»). Однако для фамилий на -енков такая балтская основа нетипична: этот суффикс почти не встречается в исторической Литве. Поэтому версия с переделкой библейского имени Валтасар выглядит убедительнее — она проще объясняет и форму, и ареал.

Кем могли быть предки Балтушенковых? Скорее всего, государственными крестьянами или однодворцами юго-западных окраин России. Фамилия не дворянская и не купеческая — она из той среды, где имя давали по святцам, но произносили по-своему, по-деревенски, не оглядываясь на книжное произношение.