Фамилия Баниаминова — яркий пример того, как в русской ономастике переплелись разные языковые традиции. В основе лежит имя Баниамин, которое является просторечной, народной формой библейского имени Вениамин (др.-евр. «сын правой руки», то есть любимый сын). В простонародье это имя нередко произносили как «Баниамин» или «Вениамин», и именно этот вариант, с начальным «Б», закрепился в фамилии. Приставка «Бан-» вместо «Вен-» — типичное явление для южнорусских и украинских говоров, где звук «в» перед гласными мог переходить в «б» (сравните: «баба» вместо «вава», «булка» вместо «вулка»). Таким образом, фамилия означает «потомок Баниамина».

Суффикс -ов- здесь не случайность. По модели образования фамилия относится к патронимическим, то есть указывает на отца: Баниаминов сын. Однако окончание -а выдаёт женскую форму. В русской традиции фамилии на -ова изначально давали замужним женщинам или вдовам, но в XIX—XX веках, когда фамилии стали наследственными, форма на -ова закрепилась за всеми женщинами рода. Получается, что носительница фамилии — прямая наследница мужской линии, восходящей к человеку по имени Баниамин.

Географически фамилия редкая, её корни скорее всего уходят в южные регионы России или в среду старообрядцев, где библейские имена бытовали в архаичных формах. Встречается она и среди народов Северного Кавказа, где русская фамилия могла быть записана по отчеству от местного имени Бениамин (например, у осетин или чеченцев). В этом случае суффикс -ов- — результат русификации при переписи.

С точки зрения социального статуса, фамилия недворянская. В дворянских родах обычно использовали книжную форму «Вениаминов». А вот «Баниаминов» — это фамилия крестьян, мещан или казаков, где имя записывали «на слух», без оглядки на церковный канон. Сейчас она крайне редка: по данным открытых баз, в России её носят не более нескольких десятков человек, что делает её своеобразным маркером локальной семейной истории.