Фамилия Барафанова, вероятнее всего, восходит к топониму Бараф – это название украинского поселка, расположенного в Днепропетровской области, к западу от Мануйловки. Можно предположить, что предок основателя данной фамилии был уроженцем или жителем этого поселка. Возник поселок в 1890-х гг., назван по фамилии владельца земель доктора Барафа. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Барафан, со временем получил фамилию Барафанова.