Фамилия Барафанов происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Барафанов, вероятнее всего, восходит к топониму Бараф – это название украинского поселка, расположенного в Днепропетровской области, к западу от Мануйловки. Можно предположить, что предок основателя данной фамилии был уроженцем или жителем этого поселка. Возник поселок в 1890-х гг., назван по фамилии владельца земель доктора Барафа. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Барафан, со временем получил фамилию Барафанов. О точном месте и времени возникновения фамилии Барафанов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Барафанов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.