Фамилию Башлыкова образовали от прозвища Башлык — и здесь мы сталкиваемся с классическим случаем, когда тюркское слово дало жизнь русской фамилии. В основе лежит слово «башлык», которое в тюркских языках означает одновременно и «капюшон», и «начальник, глава». Это расхождение в значениях и породило две основные версии происхождения прозвища.

Первая версия — бытовая, «вещественная». Башлык — это суконный остроконечный капюшон с длинными концами-лопастями, которые в непогоду обматывали вокруг шеи. Такую деталь одежды носили в Средней Азии поверх другого головного убора. Прозвище Башлык могли дать человеку, который постоянно ходил в таком капюшоне, шил их или торговал ими. В этом же ряду стоит и свадебный обычай: у некоторых тюркских народов башлыком называли выкуп за невесту, который состоял из остроконечного колпака. Соответственно, прозвище могло закрепиться за женихом или за тем, кто участвовал в сватовстве.

Вторая версия — социальная. «Башлык» от тюркского «баш» (голова, начало) означает «главарь, старшина, начальник». Так могли прозвать человека, занимавшего руководящее положение — сельского старосту, десятника, предводителя небольшого отряда. В русских документах XVI–XVII веков слово «башлык» в значении «начальник» встречается в южных и восточных регионах, где было сильное тюркское влияние.

Обе версии правдоподобны, но социальная (от «начальника») встречается в ономастике реже, чем прозвища по предметам одежды, поэтому чуть более интересна с точки зрения истории. Фамилия закрепилась с типичным русским суффиксом -ов, указывающим на принадлежность: Башлыков — сын Башлыка. Женская форма Башлыкова, таким образом, означает «дочь или жена Башлыкова».

Фамилия не относится к числу очень редких, но и массовой не стала. Она встречается в основном в Поволжье, на Урале и в южных регионах России — там, где русское население исторически контактировало с тюркскими народами. Это не дворянская фамилия, а скорее крестьянская или казачья, что подтверждается её прозрачной прозвищной основой.