Фамилия Баштханова — редкий пример тюркского именования, где за основу взято составное имя Баштхан. Его разбирают на две части: «башт» (с татарского — «вначале», «сперва») и «хан» («повелитель», «властелин»). Целиком имя переводится как «первый хан». Называя так сына, родители желали ему власти и богатства, что вполне вписывается в традицию восточных имён-пожеланий.

Словообразовательная модель здесь простая: фамилия образована от мужского имени через суффикс -ов, который в русском языке закрепил значение принадлежности («чей?» — потомок Баштхана). Женская форма Баштханова — это не отдельная фамилия, а грамматическое склонение по роду, что типично для русской паспортной системы.

Хотя основа явно тюркская и отсылает к титулу «хан», география бытования фамилии неожиданная. В Книге памяти калмыцкого народа упоминается священник Баштханова Джиджа Джаднаевич, родившийся в 1934 году на хуторе Утга в Калмыкии. Это указывает на то, что фамилия могла закрепиться в среде калмыков — народа монгольского происхождения, но испытавшего сильное тюркское влияние. Вероятно, имя Баштхан бытовало не только у татар, но и у соседних народов, где титул «хан» был привычен, а «башт» осмыслялся как указание на первенство.