Фамилия Батршин образована от личного имени Батырша (фонетический вариант — Батыршах). Это имя составное: первая часть восходит к древнетюркскому слову «батыр» — «воин, защитник», вторая — к персидскому «шах» («хан, повелитель; владелец, хозяин»). В составе мужских имён элемент «шах» придаёт значение «самый лучший», «самый первый», «самый главный». Таким образом, имя Батырша буквально означает «самый лучший защитник». Скорее всего, его давали долгожданному сыну в надежде, что он вырастет смелым и храбрым защитником семьи и народа.

Фамилия записана с выпадением гласного «ы» — это результат действия фонетических законов в тюркских языках, где безударные гласные могли редуцироваться. Суффикс -ин в русской фамилии указывает на принадлежность: «сын Батырши» или «из рода Батырши». Такая модель характерна для фамилий, возникших в среде татар, башкир и других тюркских народов, которые входили в состав Российской империи.

Есть и вторая версия: фамилия может быть связана с топонимом — названием деревни Батрша в Буздякском районе Республики Башкортостан. Если предок получил прозвище по месту жительства, то фамилия указывает на выходца из этого селения. Обе гипотезы не противоречат друг другу: имя Батырша было распространено, а деревня могла получить название по имени первопоселенца.

Фамилия Батршин — редкая, её носители встречаются преимущественно в Башкортостане и соседних регионах. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках она фиксируется в среде тептярей и башкир, что указывает на её давнюю историю в этом крае.