Фамилия Байгенжинов — редкий пример, где тюркская основа сочетается с русским патронимическим суффиксом. Она образована от личного имени Байгенжин, которое, в свою очередь, состоит из двух частей: «бай» (богатый, могучий, господин) и «генжин» (искаженное «хенджин» или «генжин» — персидское «сокровище», «клад»). Таким образом, имя Байгенжин означает «богатое сокровище» или «владелец сокровищницы». Это составное имя, типичное для казахской и каракалпакской антропонимии, где «бай» часто выступает первым компонентом, указывая на достаток или социальный статус.

Суффикс «-ов» в окончании указывает на русскую модель фамилообразования: «чей?» — Байгенжинов, то есть «сын (или потомок) Байгенжина». Такая форма закреплялась в документах в XIX–XX веках, когда представители кочевых народов получали фамилии по отцу, и чиновники записывали их по привычной русской схеме. Без этого суффикса фамилия звучала бы как Байгенжин, но в русском языке форма на «-ов» стала стандартной.

Географически фамилия тяготеет к западному Казахстану и северному Приаралью, особенно к Актюбинской и Кызылординской областям. Встречается также среди казахов Оренбуржья. Носители фамилии, скорее всего, происходят из рода, где ценилось имя, подчеркивающее накопление не только материальных благ, но и знаний или скота — главного мерила богатства в степи.

Интересная деталь: в некоторых вариантах записи фамилия могла фиксироваться как Байгенджинов или Байгеншин. Разница в написании связана с тем, что звук «дж» в казахском языке мягче русского «ж», и при передаче в паспортных столах его могли записать по-разному. Это не меняет значения, но говорит о живой устной традиции, которая не сразу поддалась письменной фиксации.