Фамилия Байлепесов — одна из тех, где сразу бросается в глаза необычная основа. Если отбросить типичный русский суффикс -ов, указывающий на принадлежность («чей?»), мы получаем корень Байлепес. Это явно не славянское слово, и здесь скрыта история миграции или смешения культур.

Самая вероятная версия происхождения — тюркская. Основа «Байлепес» может быть сложена из двух частей: «бай» (богатый, знатный, господин) и «лепес». Слово «лепес» или «лепёс» в некоторых тюркских языках (например, в казахском и башкирском) означает «лепёшка», «хлеб». Таким образом, прозвище Байлепес могло означать «богатый хлебом» или «господин лепёшек» — так могли назвать хлебосольного человека, щедрого хозяина, у которого всегда полный стол. В переносном смысле — зажиточный, не знающий голода человек.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с личным именем. В тюркской ономастике встречаются составные имена, где «бай» выступает первой частью, а вторая — имя или титул. Однако «Лепес» как самостоятельное имя почти не фиксируется, что делает «хлебную» версию более правдоподобной.

Модель образования типична для регионов, где русская фамильная система накладывалась на тюркские прозвища: к основе добавили суффикс -ов, превратив прозвище в фамилию. Произошло это, скорее всего, в XIX веке при массовом учёте населения. Носители фамилии Байлепесовы исторически могли жить в Оренбургской губернии, на Урале или в Западной Сибири — в зоне контакта русских и тюркских народов. Сейчас фамилия редкая, встречается в основном в России и Казахстане.