Фамилия Байсеитова — женская форма фамилии Байсеитов. Её основа — тюркское составное имя Байсеит, которое переводят как «богатый Сейт» или «главный Сейт». Первая часть «бай» в тюркских языках означает «богатый, хозяин, господин», вторая — арабское имя Сейит (Сейт, Саид), то есть «господин, предводитель». Таким образом, имя Байсеит — это усилительная конструкция: «очень знатный господин» или «богатый предводитель». Давали такое имя, скорее всего, в казахской или ногайской среде, где составные имена с компонентом «бай» были распространены.

Разобрать фамилию по суффиксам просто: к имени Байсеит добавлен русский патронимический суффикс -ов (в женском роде — -ова). Такая модель образования типична для фамилий, которые оформились в XIX–XX веках при переходе тюркских народов к русской паспортной системе. Суффикс -ов, а не -ин, указывает на то, что основа заканчивается на согласный (твёрдый звук «т»).

Интересно, что в русском написании фамилия закрепилась с буквой «и» в первом слоге: Байсеитова, хотя в исходном тюркском произношении возможен вариант Байсеiт (с долгим «е»). Это результат адаптации через русскую графику, где «ей» передаёт звук, близкий к «эй». В казахском языке фамилия пишется как Байсейітова, и там ясно видна основа «Сейіт» (вариант имени Сейит).

Географически фамилия Байсеитова встречается прежде всего в Казахстане и среди казахов в приграничных регионах России (Астраханская, Оренбургская области). Встречается и в Башкортостане, но реже. Социально предки носителей фамилии — это, вероятно, представители казахских родов, где имя Байсеит давали в семьях, стремившихся подчеркнуть статус или благосостояние. Никакого прямого указания на сословие (дворянство или крестьянство) фамилия не несёт: в кочевой среде «бай» — это скорее почётное прозвище или пожелание, а не сословный маркер.