Фамилия Байсейтова — женская форма от Байсейтов, и её разбор стоит начать с мужской основы. Это фамилия тюркского происхождения, скорее всего казахского или ногайского, с прозрачной внутренней формой. Основа «Байсейт» — личное имя, сложенное из двух компонентов: «бай» (богатый, господин, уважаемый человек) и «сейт» (арабское سيد — «господин», «предводитель», в тюркской среде часто употребляется как часть имени в значении «потомок пророка» или просто «почтенный»). Таким образом, имя Байсейт можно перевести как «богатый господин» или «уважаемый предводитель». Суффикс «-ов/-ев» в русской передаче указывает на принадлежность: «сын Байсейта» или «из рода Байсейта».

Географически фамилия Байсейтова чаще всего встречается в Казахстане, особенно в южных и западных областях, а также среди казахской диаспоры в России и Узбекистане. Это типичная патронимическая фамилия, образованная по русской модели, которая закрепилась у тюркских народов в XIX–XX веках при переходе к оседлому образу жизни и паспортной системе. Интересно, что в казахской ономастике есть и однокоренные фамилии — Байсейтов, Байсейт, а также варианты с другим суффиксом, например, Байсейтович, но они редки.

Сословная принадлежность предков не фиксируется однозначно: имя Байсейт могло принадлежать как зажиточному скотоводу или баю, так и человеку, чтимому за происхождение от сейидов (потомков пророка Мухаммеда). В любом случае, фамилия указывает на уважение к роду, а не на ремесло или прозвище. Споров о происхождении почти нет — тюркская этимология надёжно подтверждается параллелями в именослове: Байсейт, Байсейтбай, Сейтбай. Единственная тонкость: в некоторых регионах «сейт» могли произносить как «саит», отсюда возможны написания Байсаитов/Байсаитова, но это уже другая ветвь.