Фамилия Беберин — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а, скорее всего, звукоподражание или детское слово. Самый прямой путь к разгадке — глагол «беберить», который в русских говорах значит «говорить невнятно, бормотать, мямлить» или «плакать, хныкать» (ср. с диалектным «бебекать» — издавать нечленораздельные звуки, о детях). В этом случае прозвище Беберя получал человек с невнятной речью, картавый или тот, кто часто хныкал. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Бебери» или «из семьи Бебериных».

Вторая, менее вероятная, но возможная версия — связь с тюркскими языками. В некоторых тюркских наречиях «бебер» обозначает детёныша верблюда или просто «малыша», «детёныша». Если предок был выходцем из тюркской среды, прозвище могло быть ласкательным или указывать на внешность (например, на сутулость или неуклюжесть, как у верблюжонка). Однако для фамилии, распространённой в центральной России, первая версия — диалектная и прозрачная — предпочтительнее.

Обратите внимание на ударение. В фамилии Беберин оно, скорее всего, падает на второй слог: Бебе́рин. Это естественно для модели с суффиксом -ин и основой, оканчивающейся на -я или -а (Беберя → Беберин). Если бы ударение было на первый слог (Бе́берин), это указывало бы на более редкий вариант, возможно, под влиянием фамилий на -ин от основ на -е (как Мерин → Меринов, но не Меринин). Но фиксация ударения в бытовой речи может различаться по регионам.

География фамилии неширокая. Беберины встречаются в основном в центральных областях России — в Тверской, Ярославской, Московской губерниях, единичные случаи на Урале. Это типичная крестьянская фамилия, образованная от уличного прозвища. В дворянских родословных книгах она не отмечена, что подтверждает её простонародное происхождение.

Словообразовательно фамилия проста: корень бебер- (или беберь-) плюс патронимический суффикс -ин. В отличие от фамилий на -ов, которые чаще образовывались от мужских имён на твёрдый согласный, -ин — типичный суффикс для основ на мягкий согласный или -а/-я. Так что, если ваш предок носил прозвище Беберя (а не Бебер), то форма Беберин — единственно верная по правилам русской антропонимики.