Фамилия Бекбосынов — один из тех случаев, когда разобрать её можно только с казахского или тюркского языков, не пытаясь втиснуть в русскую модель. Основа здесь — личное имя Бекбосын, которое состоит из двух корней: «бек» (вождь, господин, князь) и «босын» (повелительное наклонение от глагола «быть», «становиться»). В буквальном, несколько архаичном прочтении имя означает «будь беком», «стань господином» — то есть пожелание высокого статуса и власти для ребёнка. Такие составные имена с глагольной частью характерны для тюркской ономастики, особенно казахской, где они выполняли роль оберегов или напутствий.

Суффикс -ов — чисто русский, патронимический. Когда в XIX–XX веках казахи получали фамилии, к имени отца (или деда) добавляли этот суффикс, и Бекбосынов буквально означает «сын Бекбосына» или «из рода Бекбосыновых». Форма без суффикса — Бекбосын — встречается как фамилия реже, но тоже существует, что указывает на сохранение исходной тюркской модели.

Географически фамилия привязана к Казахстану, прежде всего к южным и западным регионам (Актюбинская, Кызылординская области), где распространён род, ведущий начало от человека с таким именем. В России носители Бекбосыновых — почти всегда потомки казахов, переехавших в советское время.

Интересная деталь: ударение в фамилии чаще падает на последний слог — Бекбосыно́в, хотя по русским правилам логичнее было бы на второй (Бекбо́сынов). Это говорит о том, что фамилию произносят с сохранением тюркского ритма, где ударение тяготеет к концу слова. Споров о происхождении почти нет — корни прозрачны, а альтернативные версии (например, связь с «бос» — «пустой») лингвистически слабы, так как имя явно составное и несёт пожелательную семантику.