Фамилия Бекхожин — редкий для русской ономастики случай, когда основа явно тюркская или казахская, а суффикс — русский, стандартный для фамилий, оформленных по модели «отечества». Разбираем её по частям.

Корень «Бекхож» восходит к двум тюркским словам: «бек» (князь, господин, военачальник) и «хожа» (вариант «ходжа» — господин, учитель, или почётное звание для потомков пророка или просто уважаемого человека). Сложение двух титулов в одном имени — распространённый приём в казахской и узбекской антропонимии. Имя Бекхожа (или Бекходжа) означало буквально «князь-господин» или «господин из бе́ков» — подчёркнуто почтительное обращение, которое давали мальчику в знатных или духовных семьях.

Русский суффикс «-ин» присоединили к основе на «-а» (Бекхожа → Бекхожин) по той же модели, что и «Пушкин» от «Пушка» или «Ильин» от «Илья». Так в XIX—XX веках фиксировали фамилии казахов, татар и других народов Российской империи, переходивших на оседлость или поступавших на государственную службу. То есть предок носителя фамилии, скорее всего, звался Бекхожа, а его дети стали Бекхожиными — «сыновьями Бекхожи».

Географически фамилия тяготеет к северному Казахстану и приграничным областям России (Оренбуржье, Астраханская губерния). Встречается и в среде поволжских татар, но реже. Интересно, что ударение в фамилии обычно падает на последний слог — Бекхожи́н, что тоже указывает на её позднее оформление по русской модели: в исходном имени Бекхожа́ ударение было на втором слоге.

Сословная принадлежность предков могла быть разной: от потомков степной аристократии до простых скотоводов, получивших имя в честь уважаемого аксакала. Однозначно сказать, был ли носитель имени Бекхожа реальным князем, невозможно — титул «бек» со временем стал частью личного имени, потеряв прямое социальное значение.