Фамилия Бекхожина — женская форма мужской фамилии Бекхожин, которая образована по русской словообразовательной модели с суффиксом -ин. Этот суффикс в русских фамилиях указывает на принадлежность: «чей?» — Бекхожина означает «дочь или жена Бекхожина». Основа фамилии — составное тюркское имя Бекхожа, где «бек» — титул, означающий «господин, князь, предводитель», а «хожа» (ходжа) — почётное звание для потомков пророка или духовных лиц в исламе, а также просто уважаемый, грамотный человек. Таким образом, имя Бекхожа буквально переводится как «господин-ходжа» или «князь-наставник».

Фамилия Бекхожин (и её женская форма Бекхожина) — яркий пример того, как русский патронимический суффикс был присоединён к тюркскому личному имени. Такие фамилии массово возникали в XIX — начале XX века, когда народы Средней Азии, Казахстана и Поволжья попадали под административное влияние Российской империи. Для учёта населения местным жителям нередко давали фамилии по имени отца или деда, оформляя их по русскому образцу. Носитель фамилии Бекхожина, скорее всего, имеет корни в казахской, узбекской или татарской среде, где имя Бекхожа было распространённым.

В отличие от многих фамилий, где основа со временем стёрлась и перестала осознаваться, здесь прозрачная семантика сохранилась: сразу видно, что предок носил высокий социальный статус или духовный авторитет. Фамилия довольно редкая, что объясняется не массовостью самого имени Бекхожа (оно уступало по популярности, например, именам вроде Ахмет или Мурат). Это делает фамилию Бекхожина не просто родовым именем, а маркером происхождения из конкретного рода, где имя предка было настолько значимым, что легло в основу фамилии.