Фамилия Бекмуллаева образована по самой распространённой в русском языке модели — с помощью суффикса -ев, который присоединяется к основе мужской фамилии Бекмулла. Этот суффикс указывает на принадлежность: Бекмуллаев — сын Бекмуллы, а Бекмуллаева — дочь или жена Бекмуллаева. Сама фамилия имеет тюркское происхождение и состоит из двух частей: «бек» (господин, князь, предводитель) и «мулла» (мусульманский священнослужитель, знаток Корана). В буквальном переводе Бекмулла — «господин-мулла» или «князь-священник».

Имя Бекмулла — составное, типичное для народов, исповедующих ислам, особенно среди татар, башкир, казахов и народов Кавказа. Первая часть «бек» в тюркских языках могла быть как социальным титулом, так и элементом имени, подчеркивающим знатность или уважение. Вторая часть «мулла» указывает на религиозную образованность. Таким образом, человек с таким именем мог происходить из семьи, где уважали и светскую власть (бек), и духовный авторитет (мулла), или же это было имя-пожелание, чтобы мальчик вырос достойным предводителем и праведником.

Фамилия Бекмуллаева — женская форма, её носительницы встречаются преимущественно в регионах России с тюркским населением: в Татарстане, Башкортостане, а также в Дагестане и других республиках Северного Кавказа. Мужская форма — Бекмуллаев. Редкость фамилии в том, что она сохранила не просто имя, а целый социальный титул в составе основы, что нечасто встречается в русских фамилиях тюркского происхождения. В отличие от более простых именных фамилий (например, от Ибрагим или Ахмет), здесь зафиксировано двойное указание на статус, что говорит о том, что предок носителя фамилии, скорее всего, был заметной фигурой в своей общине.

С точки зрения словообразования, фамилия Бекмуллаева — яркий пример того, как тюркские имена адаптировались в русском языке через патронимический суффикс. Она не имеет отношения к русским дворянским фамилиям на -ский или -ов, а является прямой калькой с имени предка, что типично для поздних фамилий, сложившихся у поволжских татар и кавказских народов в XIX-XX веках.