Фамилия Бекпаева — женская форма фамилии Бекпаев, и её разбор стоит начать с мужского варианта. Основа здесь — «бек», тюркский титул, обозначающий князя, господина или военачальника. Вторая часть, «пай», восходит к тюркскому «бай» — богатый, уважаемый человек, хозяин. Таким образом, Бекпай — это составное имя или прозвище, которое можно перевести как «богатый бек» или «господин-князь». Суффикс -ев (в женской форме -ева) указывает на принадлежность: буквально «из рода Бекпая».

Такая модель образования — типичная для тюркских фамилий, которые русифицировались в XIX–XX веках. Фамилия Бекпаева, скорее всего, казахского или башкирского происхождения, реже — татарского или ногайского. В этих культурах имя Бекпай встречалось как личное, а после переписи населения и паспортизации закрепилось в качестве фамилии. Интересно, что двойное титулование в основе — «бек» и «бай» — не редкость для кочевых обществ: оно подчеркивало и знатность, и состоятельность рода.

Географически фамилия Бекпаева распространена в Казахстане, особенно в южных и западных областях, а также среди казахов, живущих в России (Астраханская, Оренбургская области). Встречается она и у башкир, но реже. Социальный контекст: носители фамилии могли происходить из среды степной аристократии (беки) или зажиточных скотоводов (баи). Однако со временем фамилия стала массовой, и сейчас её обладатели — люди самых разных профессий.

С точки зрения словообразования, фамилия Бекпаева стоит в ряду таких однокоренных, как Бекпаев, Бекбаев, Бекпанов. Отличие — в суффиксе: -ев здесь присоединился к основе на «й», что дало написание «паев», а не «паев» (хотя в устной речи разницы нет). В дореволюционных записях можно встретить вариант Бекпайев — более точная передача произношения, но в советское время написание упростили.