Фамилия Бельковец выделяется в ряду сходных по звучанию фамилий прежде всего своим суффиксом. Подавляющее большинство русских фамилий образуется с помощью -ов/-ев, -ин или -ский, а вот суффикс -ец встречается реже и несёт особый смысл. В восточнославянской традиции он указывал на принадлежность человека к определённой местности или на его происхождение оттуда. Бельковец — это буквально «выходец из Белькова» или «житель Белькова».

Названий с корнем Бельк- на карте России и Украины несколько. Это могут быть деревни Бельково, Бельковцы, а также урочища с похожим именем. Само название поселения, скорее всего, произошло от прозвища или нецерковного имени Белько. В древнерусском языке «бель» нередко означало что-то белое, светлое, чистое. Белько могли прозвать человека с очень светлыми волосами или кожей, либо того, кто носил белую одежду (например, мельника, испачканного мукой, но скорее — просто выделявшегося внешностью). Таким образом, цепочка проста: прозвище Белько дало название деревне Бельково (или Бельков), а житель этой деревни получал прозвище Бельковец. Со временем это прозвище закрепилось как фамилия.

Есть и более прозаичная версия, без географического посредника. В некоторых говорах «бельковец» могли называть человека, занимавшегося выделкой беличьих шкурок или торговлей ими (от «бель» — белка). Однако эта гипотеза менее вероятна: суффикс -ец редко прикреплялся напрямую к названию профессии в такой форме. Обычно для ремесленников использовали -ник (белочник) или -арь.

Интересно, что фамилия Бельковец не является ни аристократической, ни крестьянской в узком смысле — она типична для мещан и однодворцев южнорусских и белорусских губерний, где модель фамилий на -ец была особенно распространена. Встречается она и в украинском варианте (Більковець), что указывает на общие корни. Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, происходят из одного или нескольких соседних родов, разошедшихся по разным регионам в XIX–XX веках.