Фамилия Белодон — редкий случай, когда корень прозрачен, а суффикс ставит в тупик. Сразу видно основу «бел-», указывающую на светлый цвет волос или кожи, но вторая часть — «-дон» — не похожа ни на типичное русское окончание, ни на распространённый суффикс. В русских фамилиях сочетание «бело-» встречается часто: Белов, Белозёров, Белокопытов. Но Белодон стоит особняком.

Скорее всего, перед нами не русская, а украинская или южнорусская фамилия, образованная по модели «прилагательное + существительное» без суффиксации. «Дон» здесь — не река и не испанское обращение, а диалектное или устаревшее слово. В южных говорах «дон» могло означать «дно» (ср. украинское «дiн», «дон» — дно), и Белодон — прозвище человека с «белым дном»: либо по светлому дну посуды, либо по какому-то ремеслу, связанному с изготовлением или чисткой доньев бочек, кадок. Есть и другая версия: «дон» — форма от «доня», «донька» (дочь) в некоторых говорах, и тогда Белодон — «белая дочь», прозвище светловолосой девушки, закрепившееся как фамилия.

Версия с рекой Дон маловероятна: фамилия Белодонский или Белодонской была бы логичнее, а краткая форма Белодон для топонимической фамилии нехарактерна. Суффикса -дон в русском словообразовании нет, поэтому фамилию не могли создать по схеме «белый + суффикс». Остаётся предположить, что Белодон — застывшее прозвище-описание, которое дали либо по внешности (белый, светлый), либо по занятию (мастер по доньям). Носители такой фамилии, скорее всего, происходят из украинских или пограничных русских губерний — Черниговской, Полтавской, Курской или Воронежской. В официальных документах XIX века фамилия почти не встречается, что говорит о её редкости и локальном бытовании.